前述したエビデンスレポート・タスクフォースのメンバーなどの利益相反に関しては、第2期、第3期のプロジェクト（2005.6-2010.5）の期間について以下の通りである。
- 岡部哲郎
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属
- 新井信
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属
- 小暮敏明
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属 (2005. 6 - 2006. 3)
- 後藤博三
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属 (2005. 6 - 2006. 3)
- 並木隆雄
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属
- 中田英之
- 株式会社ツムラによる寄附講座に所属 (2005. 7 - 2008. 3)
- 津谷喜一郎
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- 日本製薬工業協会による寄付講座に所属 (2005. 6 - 2006. 3)
- 東和薬品株式会社による寄附講座に所属 (2006. 4 -)
